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對(duì)癌癥的分子復(fù)雜性和致癌驅(qū)動(dòng)因素的作用日益深入的理解已經(jīng)使得癌癥的治療越來(lái)越有針對(duì)性。通常在診斷時(shí),醫(yī)生利用獲得的腫瘤組織進(jìn)行活組織檢查從而獲得靶向治療所需的分子分析結(jié)果。然而,腫瘤組織活檢有幾個(gè)局限性,包括手術(shù)的創(chuàng)傷和由于腫瘤異質(zhì)性或者低腫瘤細(xì)胞比例導(dǎo)致假陰性結(jié)果的風(fēng)險(xiǎn)。另外,多達(dá)49%的晚期或轉(zhuǎn)移性非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)沒(méi)有獲取的腫瘤組織。因此,通過(guò)體液如血液或尿液進(jìn)行的腫瘤相關(guān)突變的非侵入性檢測(cè)是基于組織活檢方法的最有吸引力的替代方法。
循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)是從腫瘤部位釋放到癌癥患者血液中的循環(huán)無(wú)細(xì)胞DNA(cfDNA)的組成部分,ctDNA作為非小細(xì)胞肺癌和其他癌癥的腫瘤組織活檢的替代物,具有巨大的應(yīng)用前景。這使得最近美國(guó)和歐洲的血液EGFR伴侶診斷試驗(yàn)的監(jiān)管批準(zhǔn)。此外,已經(jīng)開(kāi)發(fā)出高度敏感和選擇性的技術(shù)來(lái)解決癌癥患者血液中經(jīng)常發(fā)現(xiàn)的相對(duì)于野生型的極低比例的腫瘤來(lái)源的突變DNA的檢測(cè)。在這方面,基于數(shù)字PCR技術(shù)的BEAMing(Beads,、Emulsification、Amplification、Magnetics)技術(shù)可以識(shí)別低至0.02%突變等位基因(MAF)的突變,已被證明是最敏感的ctDNA的突變檢測(cè),并且與下一代測(cè)序(NGS)技術(shù)達(dá)到了相似的水平(0.05%MAF)。除此之外,還需克服的困難是患者的體細(xì)胞基因的改變帶來(lái)的少量的ctDNA檢測(cè)是目前的腫瘤生物學(xué)無(wú)法完成的??蓹z測(cè)ctDNA的患者的比例因其適應(yīng)癥、疾病階段、腫瘤負(fù)荷和其他臨床特征而異。在NSCLC中,EGFR激活突變的患者(包括外顯子19缺失和外顯子21的L858R點(diǎn)突變)是可以接受各種EGFR抑制劑治療的,并獲得FDA批準(zhǔn)的首例液體活檢項(xiàng)目。在使用第三代EGFR酪氨酸激酶抑制劑(EGFR-TKI)來(lái)治療EGFR T790M抗性突變的復(fù)發(fā)性NSCLC患者時(shí),由于血液中ctDNA的水平有限,T790M檢測(cè)的假陰性率經(jīng)常>30%。第一個(gè)FDA批準(zhǔn)的Rochecobas?EGFR Mutation Test v2 for T790M的靈敏度僅為58.4%,特異性為80.4%。
克服ctDNA突變檢測(cè)數(shù)量限制的一個(gè)手段可能會(huì)是來(lái)自外泌體的腫瘤相關(guān)RNA。外泌體是由活細(xì)胞(包括腫瘤細(xì)胞)釋放的小囊泡,并攜帶RNA、DNA和蛋白質(zhì)。使用外泌體RNA(exoRNA)來(lái)識(shí)別腫瘤起源的體細(xì)胞突變先前已被證明,但exoRNA和cfDNA二者的組合提?。╡xoNA)尚未被闡述,也沒(méi)有闡述比單獨(dú)使用ctDNA的優(yōu)勢(shì)。外泌體的一個(gè)重要特征是,存在于血漿和其他生物流體的核酸是在這些囊泡的內(nèi)腔中的,這些核酸結(jié)構(gòu)完好,免受核酸酶的消化,是良好質(zhì)量的RNA。此外,外泌體從由活細(xì)胞中主動(dòng)釋放出來(lái),而ctDNA則是通過(guò)細(xì)胞凋亡或壞死從死亡細(xì)胞中釋放出來(lái)的。研究人員推測(cè),外泌體RNA上存在的額外突變以及它們來(lái)源于活躍生長(zhǎng)的腫瘤細(xì)胞可能有助于改進(jìn)目前基于血漿的EGFR突變檢測(cè)。
在這項(xiàng)發(fā)表于Annals of Oncology雜志(IF 11.854)的研究中,研究人員分析了來(lái)自IIIB和IV期NSCLC患者參加TIGER-X試驗(yàn)(第三代EGFR抑制劑rociletinib的1/2期臨床試驗(yàn),編號(hào)NCT01526928)的84個(gè)血漿樣品。研究人員分離外泌體和ctDNA,并提取核酸,并使用有針對(duì)性的NGS分析(EXO1000)來(lái)篩選EGFR突變。該研究的主要目的是檢測(cè)同時(shí)提取exoRNA和ctDNA是否會(huì)增加拷貝數(shù)和EGFR突變檢測(cè)的敏感性,尤其是在通過(guò)腫瘤活組織檢查已知EGFR突變陽(yáng)性的患者中,不通過(guò)只單獨(dú)的分析ctDNA鑒定EGFR突變檢測(cè)。研究人員將數(shù)據(jù)與匹配的組織數(shù)據(jù)進(jìn)行比較,并匹配先前用BEAMing獲得的ctDNA結(jié)果。此外他們通過(guò)分析治療15天后收集的血漿,檢測(cè)了治療期間EGFR突變水平的變化是否與治療結(jié)果相關(guān)。
研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),對(duì)于exoNA(exoRNA和cfDNA二者的組合),檢測(cè)EGFR激活突變的靈敏度為98%,EGFR T790M為90%。BEAM對(duì)ctDNA的敏感性分別為82%,T790M為84%。在一胸內(nèi)轉(zhuǎn)移亞組患者中(M0/M1a; n=21),利用exoNA的檢測(cè),EGFR激活突變的檢測(cè)靈敏度從26%上升到74%(p = 0.003),T790M的靈敏度從19%上升到31%。綜上所述,exoRNA和ctDNA的聯(lián)合檢測(cè)增加了血漿中EGFR突變檢測(cè)的敏感性,并在已知具有低水平ctDNA的M0/M1a患者中看到檢測(cè)的改善,該方法也對(duì)于僅基于ctDNA的突變檢測(cè)提出了新的挑戰(zhàn)。(生物谷世聯(lián)博研Bioexcellence)
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