2018年4月19日/生物谷BIOON/---在一項(xiàng)新的研究中，美國(guó)北卡羅萊納州立大學(xué)的Rodolphe Barrangou、Alexandra Crawley和AgBiome公司的James Henriksen開(kāi)發(fā)出一種被稱作CRISPRdisco（CRISPR discovery）的自動(dòng)化生物信息學(xué)工具，該工具旨在提高日益多樣化的CRISPR-Cas基因組編輯系統(tǒng)的實(shí)用性和可用性，并幫助科學(xué)家們鑒定出基因組中的CRISPR重復(fù)序列和cas基因。這種可免費(fèi)獲得的軟件提供標(biāo)準(zhǔn)化的高通量分析方法來(lái)檢測(cè)CRISPR重復(fù)序列并準(zhǔn)確地確定它們的類別、類型和亞型。相關(guān)研究結(jié)果于2018年4月9日在線發(fā)表在CRISPR Journal期刊上，論文標(biāo)題為“CRISPRdisco: An Automated Pipeline for the Discovery and Analysis of CRISPR-Cas Systems”。Barrangou也是CRISPR Journal期刊的主編。

CRISPR/Cas系統(tǒng)類型分布圖，圖片來(lái)自CRISPR Journal, doi:10.1089/crispr.2017.0022。

在這項(xiàng)研究中，這些研究人員利用CRISPRdisco對(duì)來(lái)自美國(guó)國(guó)家生物信息技術(shù)中心參考序列數(shù)據(jù)庫(kù)（NCBI RefSeq database）的2777個(gè)完整基因組進(jìn)行分析，從中鑒定潛在的CRISPR-Cas系統(tǒng)，并對(duì)它們進(jìn)行分類。他們強(qiáng)調(diào)了能夠區(qū)分完整的和不完整的CRISPR系統(tǒng)的重要性，確定了潛在完整的和功能性的CRISPR-Cas系統(tǒng)之間在體內(nèi)的關(guān)聯(lián)性，并且利用計(jì)算機(jī)模擬（in silico）確定了CRISPR-Cas多樣性。重要的是，所有人都可通過(guò)GitHub網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)（一個(gè)面向開(kāi)源及私有軟件項(xiàng)目的托管平臺(tái)）獲得這個(gè)軟件，并且該軟件能夠讓新手分析和描述各種基因組數(shù)據(jù)集中的CRISPR-Cas系統(tǒng)。

CRISPR Journal期刊執(zhí)行編輯Kevin Davies博士說(shuō)，“新的生物信息學(xué)工具、程序和數(shù)據(jù)庫(kù)正在協(xié)助推動(dòng)CRISPR革命，而且我們很樂(lè)意為驗(yàn)證其中的一些重要平臺(tái)提供論壇?！保ㄉ锕?Bioon.com）

參考資料：

Crawley Alexandra B. , Henriksen James R. , and Barrangou Rodolphe. CRISPRdisco: An Automated Pipeline for the Discovery and Analysis of CRISPR-Cas Systems. CRISPR Journal, Published Online:9 Apr 2018, doi:10.1089/crispr.2017.0022