
在國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(項(xiàng)目編號:31722027)等資助下,浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)中心郭國驥教授團(tuán)隊(duì)在單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)及哺乳動物全細(xì)胞表達(dá)譜系分析研究中取得突破性進(jìn)展。相關(guān)成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板測序技術(shù)繪制小鼠細(xì)胞圖譜)為題,于2018年2月23日在生命科學(xué)國際頂尖期刊Cell(《細(xì)胞》)雜志在線發(fā)表。論文鏈接:http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)30116-8。
長久以來,生命科學(xué)的研究主要針對群體細(xì)胞樣品進(jìn)行處理、分析和統(tǒng)計(jì)進(jìn)而獲得均值水平的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。直到近幾年單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)的出現(xiàn),才使我們能夠從單細(xì)胞的水平更加精確地解析每個細(xì)胞究竟在表達(dá)哪些基因,在機(jī)體分化、再生、衰老以及病變過程中這些基因的表達(dá)又發(fā)生哪些變化以及變化的幅度有多大等問題。因此,單細(xì)胞組學(xué)分析技術(shù)不僅在方法學(xué)上是繼傳統(tǒng)的細(xì)胞檢測、分類和鑒定技術(shù)的一次突破,而且其結(jié)果也將會對經(jīng)典的細(xì)胞發(fā)生、組織分化、器官發(fā)育及功能穩(wěn)態(tài)維持的分子細(xì)胞機(jī)制帶來新的理解和認(rèn)識。
在這項(xiàng)工作中,郭國驥教授團(tuán)隊(duì)自主開發(fā)一套高精度、低成本、國產(chǎn)化的Microwell-seq高通量單細(xì)胞分析平臺,對來自小鼠近50種器官組織的40余萬個細(xì)胞進(jìn)行系統(tǒng)性的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,構(gòu)建首個哺乳動物全細(xì)胞圖譜。該研究基本涵蓋了哺乳動物體內(nèi)的各種主要細(xì)胞類型,并對每一種器官內(nèi)的組織細(xì)胞亞型,基質(zhì)細(xì)胞亞型,血管內(nèi)皮細(xì)胞亞型和免疫細(xì)胞亞型的基因表達(dá)譜進(jìn)行詳細(xì)描述,繪制一幅精美的“細(xì)胞地圖”。更為有趣的是,這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)來自于不同組織的基質(zhì)細(xì)胞,具有完全不同的基因表達(dá)特征,從而對于組織特異性微環(huán)境行使重要的調(diào)節(jié)作用。同時此項(xiàng)工作還構(gòu)建小鼠單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫以及小鼠細(xì)胞圖譜網(wǎng)站(http://bis.zju.edu.cn/MCA/)以提供單細(xì)胞數(shù)據(jù)比對系統(tǒng),任何單細(xì)胞表達(dá)譜數(shù)據(jù)都可以通過單細(xì)胞比對分析尋找到它所對應(yīng)的細(xì)胞類型和來源。這項(xiàng)成果將為細(xì)胞命運(yùn)決定的機(jī)制研究、再生醫(yī)學(xué)的移植前細(xì)胞鑒定以及臨床疾病的細(xì)胞水平診斷提供技術(shù)手段和分析方法。(生物谷Bioon.com)
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