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        導(dǎo)航

        聯(lián)合外泌體RNA和ctDNA的液體活檢,對EGFR突變的檢測最為有效

        來源:世聯(lián)博研(Bioexcellence)


        對癌癥的分子復(fù)雜性和致癌驅(qū)動因素的作用日益深入的理解已經(jīng)使得癌癥的治療越來越有針對性。通常在診斷時,醫(yī)生利用獲得的腫瘤組織進(jìn)行活組織檢查從而獲得靶向治療所需的分子分析結(jié)果。然而,腫瘤組織活檢有幾個局限性,包括手術(shù)的創(chuàng)傷和由于腫瘤異質(zhì)性或者低腫瘤細(xì)胞比例導(dǎo)致假陰性結(jié)果的風(fēng)險。另外,多達(dá)49%的晚期或轉(zhuǎn)移性非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)沒有獲取的腫瘤組織。因此,通過體液如血液或尿液進(jìn)行的腫瘤相關(guān)突變的非侵入性檢測是基于組織活檢方法的最有吸引力的替代方法。

        循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)是從腫瘤部位釋放到癌癥患者血液中的循環(huán)無細(xì)胞DNA(cfDNA)的組成部分,ctDNA作為非小細(xì)胞肺癌和其他癌癥的腫瘤組織活檢的替代物,具有巨大的應(yīng)用前景。這使得最近美國和歐洲的血液EGFR伴侶診斷試驗的監(jiān)管批準(zhǔn)。此外,已經(jīng)開發(fā)出高度敏感和選擇性的技術(shù)來解決癌癥患者血液中經(jīng)常發(fā)現(xiàn)的相對于野生型的極低比例的腫瘤來源的突變DNA的檢測。在這方面,基于數(shù)字PCR技術(shù)的BEAMing(Beads,、Emulsification、Amplification、Magnetics)技術(shù)可以識別低至0.02%突變等位基因(MAF)的突變,已被證明是最敏感的ctDNA的突變檢測,并且與下一代測序(NGS)技術(shù)達(dá)到了相似的水平(0.05%MAF)。除此之外,還需克服的困難是患者的體細(xì)胞基因的改變帶來的少量的ctDNA檢測是目前的腫瘤生物學(xué)無法完成的??蓹z測ctDNA的患者的比例因其適應(yīng)癥、疾病階段、腫瘤負(fù)荷和其他臨床特征而異。在NSCLC中,EGFR激活突變的患者(包括外顯子19缺失和外顯子21的L858R點突變)是可以接受各種EGFR抑制劑治療的,并獲得FDA批準(zhǔn)的首例液體活檢項目。在使用第三代EGFR酪氨酸激酶抑制劑(EGFR-TKI)來治療EGFR T790M抗性突變的復(fù)發(fā)性NSCLC患者時,由于血液中ctDNA的水平有限,T790M檢測的假陰性率經(jīng)常>30%。第一個FDA批準(zhǔn)的Rochecobas?EGFR Mutation Test v2 for T790M的靈敏度僅為58.4%,特異性為80.4%。

        克服ctDNA突變檢測數(shù)量限制的一個手段可能會是來自外泌體的腫瘤相關(guān)RNA。外泌體是由活細(xì)胞(包括腫瘤細(xì)胞)釋放的小囊泡,并攜帶RNA、DNA和蛋白質(zhì)。使用外泌體RNA(exoRNA)來識別腫瘤起源的體細(xì)胞突變先前已被證明,但exoRNA和cfDNA二者的組合提取(exoNA)尚未被闡述,也沒有闡述比單獨使用ctDNA的優(yōu)勢。外泌體的一個重要特征是,存在于血漿和其他生物流體的核酸是在這些囊泡的內(nèi)腔中的,這些核酸結(jié)構(gòu)完好,免受核酸酶的消化,是良好質(zhì)量的RNA。此外,外泌體從由活細(xì)胞中主動釋放出來,而ctDNA則是通過細(xì)胞凋亡或壞死從死亡細(xì)胞中釋放出來的。研究人員推測,外泌體RNA上存在的額外突變以及它們來源于活躍生長的腫瘤細(xì)胞可能有助于改進(jìn)目前基于血漿的EGFR突變檢測。

        在這項發(fā)表于Annals of Oncology雜志(IF 11.854)的研究中,研究人員分析了來自IIIB和IV期NSCLC患者參加TIGER-X試驗(第三代EGFR抑制劑rociletinib的1/2期臨床試驗,編號NCT01526928)的84個血漿樣品。研究人員分離外泌體和ctDNA,并提取核酸,并使用有針對性的NGS分析(EXO1000)來篩選EGFR突變。該研究的主要目的是檢測同時提取exoRNA和ctDNA是否會增加拷貝數(shù)和EGFR突變檢測的敏感性,尤其是在通過腫瘤活組織檢查已知EGFR突變陽性的患者中,不通過只單獨的分析ctDNA鑒定EGFR突變檢測。研究人員將數(shù)據(jù)與匹配的組織數(shù)據(jù)進(jìn)行比較,并匹配先前用BEAMing獲得的ctDNA結(jié)果。此外他們通過分析治療15天后收集的血漿,檢測了治療期間EGFR突變水平的變化是否與治療結(jié)果相關(guān)。

        研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),對于exoNA(exoRNA和cfDNA二者的組合),檢測EGFR激活突變的靈敏度為98%,EGFR T790M為90%。BEAM對ctDNA的敏感性分別為82%,T790M為84%。在一胸內(nèi)轉(zhuǎn)移亞組患者中(M0/M1a; n=21),利用exoNA的檢測,EGFR激活突變的檢測靈敏度從26%上升到74%(p = 0.003),T790M的靈敏度從19%上升到31%。綜上所述,exoRNA和ctDNA的聯(lián)合檢測增加了血漿中EGFR突變檢測的敏感性,并在已知具有低水平ctDNA的M0/M1a患者中看到檢測的改善,該方法也對于僅基于ctDNA的突變檢測提出了新的挑戰(zhàn)。(世聯(lián)博研(Bioexcellence)世聯(lián)博研Bioexcellence)


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