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-在一項(xiàng)新的研究中,來(lái)自美國(guó)約翰霍普金斯大學(xué)基梅爾癌癥中心等研究機(jī)構(gòu)的研究人員開發(fā)出一種血液測(cè)試方法,該方法一次能夠篩選八種常見的癌癥類型,并有助于確定癌癥所在的部位。相關(guān)研究結(jié)果于2018年1月18日在線發(fā)表在Science期刊上,論文標(biāo)題為“Detection and localization of surgically resectable cancers with a multi-analyte blood test”。
這種被稱作CancerSEEK的測(cè)試方法是一種獨(dú)特的非侵入性的多分析物測(cè)試方法,可同時(shí)評(píng)估8種癌蛋白的水平,以及血液中的循環(huán)DNA是否存在癌基因突變。這種測(cè)試方法旨在篩選八種常見的癌癥類型,這些癌癥導(dǎo)致美國(guó)60%以上的癌癥死亡病例。在當(dāng)前的這種測(cè)試方法涵蓋的這8種癌癥中,有5種還沒有篩查測(cè)試方法。
論文共同通信作者、約翰霍普金斯大學(xué)腫瘤學(xué)教授、病理學(xué)教授Nickolas Papadopoulos博士說(shuō),“將選定的生物標(biāo)志物組合用于早期檢測(cè)有可能改變我們篩查癌癥的方式,并且是使用藥物組合來(lái)治療癌癥的基本原則?!?/span>
論文第一作者、約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)博士Joshua Cohen說(shuō),“循環(huán)腫瘤DNA突變能夠是癌癥的高度特異性標(biāo)志物,為了利用這種內(nèi)在的特異性,我們?cè)噲D開發(fā)一種小而強(qiáng)大的能夠檢測(cè)絕大多數(shù)癌癥中至少一種突變的突變盤(mutation panel)。事實(shí)上,讓這種突變盤保持較小的規(guī)模對(duì)盡可能減少假陽(yáng)性結(jié)果和讓這些篩查試驗(yàn)的費(fèi)用負(fù)擔(dān)得起是至關(guān)重要的?!?/span>
研究人員起初探究了數(shù)百個(gè)基因和40個(gè)蛋白標(biāo)志物,最終將它們的數(shù)量減少到16個(gè)基因和8個(gè)蛋白。他們指出,這種分子測(cè)試僅針對(duì)癌癥篩查,因此不同于其他的分子測(cè)試,后者依賴于分析大量的癌癥驅(qū)動(dòng)基因來(lái)鑒定治療上可靶向的靶標(biāo)。
在這項(xiàng)新的研究中,這種測(cè)試方法對(duì)癌癥的特異性超過99%。約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院路德維希癌癥遺傳學(xué)與治療中心聯(lián)合主任Kenneth Kinzler博士說(shuō),“非常高的特異性是必不可少的,這是因?yàn)榧訇?yáng)性結(jié)果能夠讓患者接受不必要的侵入性隨訪測(cè)試以便證實(shí)癌癥的存在?!边@種測(cè)試方法對(duì)812名健康對(duì)照者進(jìn)行測(cè)試,僅產(chǎn)生7個(gè)假陽(yáng)性結(jié)果。
這種測(cè)試方法對(duì)1005名患上非轉(zhuǎn)移性的I~I(xiàn)II期卵巢癌、肝癌、胃癌、胰腺癌、食管癌、結(jié)直腸癌,肺癌或乳腺癌的患者進(jìn)行了評(píng)估。中位總體靈敏度(median overall sensitivity, MOS),或者說(shuō)發(fā)現(xiàn)癌癥的能力,最高時(shí)為針對(duì)卵巢癌的98%,最低時(shí)為針對(duì)乳腺癌的33%。對(duì)于沒有篩查測(cè)試的這五種癌癥(卵巢癌、肝癌、胃癌、胰腺癌和食管癌)而言,它們的靈敏度為69%~98%。
論文共同通信作者、約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)研究所腫瘤學(xué)系副教授、生物統(tǒng)計(jì)學(xué)副教授Cristian Tomasetti博士說(shuō),“我們的這種測(cè)試方法的新穎之處在于它將觀察各種DNA突變的可能性與幾種蛋白的水平結(jié)合起來(lái),以便作出最后的決定。我們的方法的另一個(gè)新的方面是它使用機(jī)器學(xué)習(xí),從而使得這種測(cè)試方法能夠準(zhǔn)確地將83%的腫瘤患者中的腫瘤位置減少到少量的解剖部位?!?/span>
雖然當(dāng)前的這種測(cè)試方法并不能檢測(cè)出每種癌癥,但是它鑒定出很多可能不會(huì)被檢測(cè)到的癌癥。路德維希癌癥遺傳學(xué)與治療中心聯(lián)合主任、腫瘤學(xué)教授、霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所研究員Bert Vogelstein博士說(shuō),“我們?nèi)缃駬碛械脑S多最有希望的癌癥治療方法僅受益于少數(shù)癌癥患者,而且我們還認(rèn)為它們是重大突破。如果我們要是在早期癌癥檢測(cè)方面取得進(jìn)展,那么我們必須開始以一種更加真實(shí)的方式研究這一點(diǎn),這是因?yàn)槲覀冋J(rèn)識(shí)到?jīng)]有任何一種測(cè)試方法能夠檢測(cè)出所有的癌癥?!?/span>
為了著重關(guān)注他們納入在CancerSEEK測(cè)試中的分析物,這些研究人員獲得了路德維希癌癥遺傳學(xué)與治療中心30多年的癌癥遺傳學(xué)研究產(chǎn)生的數(shù)據(jù),以及來(lái)自許多其他機(jī)構(gòu)的數(shù)據(jù)。路德維希癌癥遺傳學(xué)與治療中心構(gòu)建出首批癌癥基因藍(lán)圖。
為了精確地確定在CancerSEEK測(cè)試中評(píng)估的最佳DNA堿基數(shù)量,這些研究人員使用了一種基于收益遞減的方法。Cohen解釋道,“你測(cè)試的DNA堿基數(shù)量越多,你能夠發(fā)現(xiàn)的基因突變就越多,但是最終你會(huì)到達(dá)一個(gè)收益遞減點(diǎn)。我們?cè)O(shè)計(jì)了我們的測(cè)試方法來(lái)反映這個(gè)收益遞減點(diǎn),從而納入對(duì)檢測(cè)癌癥有用的DNA標(biāo)志物和清除那些不會(huì)增加益處的DNA標(biāo)志物?!苯Y(jié)果就是一組相對(duì)較少的高度選擇性的DNA標(biāo)志物。
Vogelstein說(shuō),“這種測(cè)試方法代表著下一步是將癌癥研究的重點(diǎn)從晚期疾病轉(zhuǎn)向早期疾病,我相信長(zhǎng)期而言,這對(duì)降低癌癥死亡將是至關(guān)重要的?!?/span>
CancerSEEK是非侵入性的,因此它在原則上能夠由基礎(chǔ)醫(yī)療機(jī)構(gòu)在開展其他的常規(guī)血液工作時(shí)進(jìn)行提供。論文共同通信作者、約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)研究所多學(xué)科胰腺囊腫項(xiàng)目主任、胃腸病學(xué)臨床主任、醫(yī)學(xué)副教授、外科學(xué)副教授、放射學(xué)副教授Anne Marie Lennon 博士說(shuō),“這有潛力顯著地影響患者。早期檢測(cè)提供了很多方法來(lái)改善患者的治療效果。最佳地,足夠早地檢測(cè)癌癥,這樣僅通過手術(shù)就可治愈它們,而且即便是僅靠手術(shù)無(wú)法治愈的癌癥當(dāng)其病情較輕時(shí)也將會(huì)對(duì)全身治療作出更好的反應(yīng)?!?span id="bs8ojahxzv" class="Apple-converted-space">
這些研究人員認(rèn)為一種將被常規(guī)地用于癌癥篩查的測(cè)試方法必須具有與其他的目前可用的針對(duì)單個(gè)癌癥開展的其他篩查測(cè)試方法(如結(jié)腸鏡檢查)相當(dāng)?shù)幕蚋偷某杀?。他們?cè)O(shè)想,CancerSEEK測(cè)試最終將花費(fèi)不到500美元。
針對(duì)這種測(cè)試方法的更大規(guī)模的研究當(dāng)前正在開展當(dāng)中。(生物谷 世聯(lián)博研Bioexcellence)
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