
近日,中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所馬占山團(tuán)隊(duì)發(fā)布了兩項(xiàng)生物信息技術(shù)(算法和軟件)可用于精準(zhǔn)診斷菌群相關(guān)疾病指標(biāo)的研發(fā),也可用于其它環(huán)境微生物群系監(jiān)測的研究。相關(guān)研究分別發(fā)表在《微生物生態(tài)學(xué)》和《科學(xué)報(bào)告》上。
現(xiàn)今,仍有一類疾?。ɡ缛橄傺?、BV、IBD、肥胖、牙周炎等),由于對(duì)其發(fā)病機(jī)制缺乏完整了解,使臨床診斷存在諸多障礙。它們具有一些共同特征:就是與人體“菌群失調(diào)”密切關(guān)聯(lián),類似于自然生態(tài)系統(tǒng)(例如森林、湖泊)失衡可能會(huì)引發(fā)生態(tài)災(zāi)害。
馬占山團(tuán)隊(duì)定義了兩類生物信息標(biāo)記(指標(biāo))算法。一類是菌群網(wǎng)絡(luò)中12種三角(基序)關(guān)系(trios),另一類是菌群網(wǎng)絡(luò)中正負(fù)比例。三角關(guān)系雖然簡單,但往往是決定系統(tǒng)格局和穩(wěn)定性的重要因素。馬占山團(tuán)隊(duì)定義的12種三角關(guān)系足以描述影響復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)格局和穩(wěn)定性的要素;而正負(fù)比例指標(biāo)顯然受到了傳統(tǒng)中醫(yī)陰陽平衡思想的啟示。
馬占山團(tuán)隊(duì)通過分析公共數(shù)據(jù)庫中已發(fā)表的菌群相關(guān)疾病的研究數(shù)據(jù),示范了兩項(xiàng)生物信息診斷技術(shù)的有效性。當(dāng)然,新診斷技術(shù)的適用性和有效性并非限于所檢驗(yàn)過的這些疾病。馬占山團(tuán)隊(duì)建立的原理、算法和軟件為用戶研發(fā)其它菌群(微生物群系)相關(guān)疾病的個(gè)性化精準(zhǔn)診斷提供了全套分析和計(jì)算技術(shù)。目前,尚無其它類似能夠用于研發(fā)可靠、特異的菌群相關(guān)疾病診斷指標(biāo)的通用技術(shù)(算法和軟件)。因此,新技術(shù)的發(fā)布為菌群相關(guān)疾病的精準(zhǔn)診斷和其他環(huán)境微生物群系監(jiān)測的研究提供了一項(xiàng)前景良好的核心使能技術(shù)。(生物谷Bioon.com)
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