結(jié)直腸癌患者癌組織定植菌群結(jié)構(gòu)與組分變化研究

目前，結(jié)直腸癌（colorectal cancer，CRC）的發(fā)病率及死亡率呈逐年增長的趨勢，而CRC的發(fā)生是機體易感性和環(huán)境因素共同作用的結(jié)果。隨著宏基因組學(xué)的深入研究和分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展，腸道定植菌群作為重要環(huán)境因素在CRC發(fā)生發(fā)展過程中的作用研究越來越受到重視。腸道定植菌群是腸道的正常菌群，如類桿菌、乳桿菌、大腸埃希菌和腸球菌等，調(diào)節(jié)宿主與環(huán)境之間處于動態(tài)平衡，作為重要的環(huán)境因素。腸道定植菌群失調(diào)及其代謝產(chǎn)物是誘發(fā)CRC的關(guān)鍵因素。

為了探討結(jié)直腸癌患者癌組織定植菌群結(jié)構(gòu)和組分變化，分析腸道定植菌群與結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系， 上海市臨床檢驗中心微生物室徐蓉， 同濟大學(xué)附屬同濟醫(yī)院檢驗科孫祖俊， 商安全， 等收集2016年1月至2017年10月同濟大學(xué)附屬同濟醫(yī)院院行胃腸外科手術(shù)的乙狀結(jié)腸28份位置匹配的組織樣本為結(jié)直腸癌組，同期收集12份健康體檢者正常腸黏膜組織樣本為對照組。采用Illumina Miseq測序技術(shù)進行細菌16S rRNA基因V3-V4區(qū)測序，分析并比較正常腸黏膜組織和癌組織定植菌群結(jié)構(gòu)與組分差異。統(tǒng)計學(xué)方法采用Mann-Whitney檢驗。

結(jié)果表明，正常腸黏膜組織與癌組織定植菌群的結(jié)構(gòu)存在顯著差異。在門水平，厚壁菌門（Firmicutes）和擬桿菌門（Bacteroidetes）在癌組織中的豐度顯著偏低（Z=-1.964，P<0.01），而變形菌門（Proteobacteria）在癌組織中的豐度則顯著偏高（Z=-1.997，P<0.01）；在屬水平，擬桿菌屬（Bacteroides）、布勞特菌屬（Blautia）、普雷沃菌屬（Prevotella）和普拉梭菌（Faecalibacterium）等在癌組織中的豐度明顯低于正常腸黏膜組織（Z=-3.008，P<0.05）；僅在正常腸黏膜組織定植且豐度排前3位是布赫納什菌屬（Buchnera）、普氏菌屬（Prevotella）和普雷沃菌科（Prevotellaceae），僅在癌組織定植且豐度排前3位是卡氏菌屬（Catonella）、庫特菌屬（Kurthia）和短單胞菌屬（Brachymonas）。

本研究表明通過鑒定腸黏膜組織定植菌群結(jié)構(gòu)及成分變化可能成為一種準確、低成本的CRC早期診斷指標，從而為CRC的預(yù)防和治療指明新的途徑。 (生物谷Bioon.com）

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