結(jié)腸直腸癌(CRC)是全球診斷率排名第三的消化道惡性腫瘤。2018年,約有881,000人死于CRC。據(jù)統(tǒng)計,超過70%的CRC位于結(jié)腸,也就是結(jié)腸癌(CC)。CC在北美、歐洲和澳大利亞等地區(qū)的發(fā)病率和死亡率非常高。近年來,亞洲國家CC的發(fā)病率也逐年遞增,CC的診斷和治療已成為全球關(guān)注的熱點問題。
早期CC患者可以通過手術(shù)等手段得到治療,5年生存率已超過90%,但晚期CC患者的中位生存期不到2年。顯然,CC的早期診斷有利于提高患者的生存率,改善臨床治療結(jié)果。但到目前為止,除了內(nèi)窺鏡檢查,幾乎沒有其他任何方法可用于CC的早期診斷。大多數(shù)CC篩查僅根據(jù)參與者的年齡、性別以及其他流行病學(xué)因素進(jìn)行初步診斷,導(dǎo)致篩查的依從性低和醫(yī)療資源大量浪費(fèi)。因此,臨床迫切需要一種侵入性小且易操作的CC早期診斷替代方法。
目前,液體活檢已經(jīng)成為癌癥早期診斷的重要研究方向。miRNAs能夠通過轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)來控制基因表達(dá),在胚胎發(fā)育、癌癥發(fā)生、免疫調(diào)節(jié)和其他生物過程中起著至關(guān)重要的作用。已有研究表明,血漿、血清和尿液中的循環(huán)miRNA有作為癌癥和其他疾病的無創(chuàng)生物標(biāo)志物的潛力。
循環(huán)miRNA來源于癌細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、凋亡細(xì)胞甚至壞死細(xì)胞,且具有高度異質(zhì)性。但目前對循環(huán)miRNA的生物學(xué)功能仍知之甚少,這在很大程度上限制了其作為生物標(biāo)志物的應(yīng)用潛力。miRNA的另一個重要來源是外泌體——小細(xì)胞外囊泡(sEV)。sEV的膜可以有效地保護(hù)內(nèi)部miRNA免受RNase的影響,從而使得sEVs衍生的miRNA比血液等體液中的循環(huán)miRNA更可靠。多項研究顯示,小細(xì)胞外囊泡(sEV)在多種疾病的早期檢測中有著重要作用,但對于sEV衍生miRNA作為早期CC特異生物標(biāo)志物的系統(tǒng)篩選尚未有報道。
近日,由首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京友誼醫(yī)院消化分中心團(tuán)隊與北京恩澤康泰團(tuán)隊合作的研究成果發(fā)表在國際外泌體頂級期刊Journal of Extracellular Vesicles(IF=11)。該研究首次報道了早期結(jié)腸癌患者血漿外泌體的miRNA圖譜,開發(fā)了可高效識別早期結(jié)腸癌的外泌體液體活檢方案,并發(fā)現(xiàn)外泌體miRNA比血漿游離miRNA更適合消化道早期癌癥診斷,可以作為CC早期診斷的一種潛在生物標(biāo)志物。
為對早期結(jié)腸癌的特異性血漿sEVs標(biāo)志物進(jìn)行系統(tǒng)性的篩選和驗證,該研究團(tuán)隊以血漿sEVs-miRNAs作為早期結(jié)腸癌標(biāo)志物,從miRNA特征鑒定、差異miRNAs篩選、標(biāo)志物篩選及驗證、標(biāo)志物在早期結(jié)腸癌中的驗證、診斷性能比較等方面,系統(tǒng)對比分析了CC患者和正常對照(NC)血漿總miRNAs。
1. sEVs的特征鑒定
利用透射電子顯微鏡(TEM)、納米顆粒追蹤分析技術(shù)(NTA)和蛋白質(zhì)印跡法(WB),研究人員對來自15名CC患者和10名正常對照的sEVs進(jìn)行了表征分析。初步研究結(jié)果顯示,經(jīng)血漿總RNA歸一后,CC患者和NC的sEVs RNA濃度、血漿總RNA濃度以及sEVs RNA在百分比方面均無顯著差異(圖1)。
2. CC患者和NC血漿中sEVs差異miRNAs的篩選
同時,研究人員還對血漿sEVs進(jìn)行了miRNA測序及差異miRNA分析(圖2)。結(jié)果顯示,有60個差異表達(dá)miRNA(DEMs)與TCGA數(shù)據(jù)庫有重疊,且每個DEM在sEVs和TCGA中有著相似的靈敏度和特異性。這60個DEMs對應(yīng)的靶基因涉及細(xì)胞骨架、細(xì)胞遷移、ATP結(jié)合、生物合成等功能以及癌癥相關(guān)通路。
3. 結(jié)腸癌相關(guān)sEVs miRNAs標(biāo)志物篩選及驗證
基于上述60個DEMs,研究人員從已報道的結(jié)直腸癌標(biāo)志物中篩選出4個候選miRNA標(biāo)志物:let-7b-3p、miR-150-3p、miR-145-3p和miR-139-3p。此外,研究人員在RNA提取前進(jìn)行了蛋白酶K和RNase的消化驗證(圖3)。研究結(jié)果顯示,4種標(biāo)志物在sEVs中未降解,而在血漿中經(jīng)酶消化后部分降解;陽性對照miR-21-5p和miR-30a-5p(已知的RNP相關(guān)miRNA)在相同處理下幾乎完全降解,表明候選miRNAs在sEVs中受到sEVs膜的保護(hù)。
在結(jié)腸癌早期診斷的驗證試驗中,研究人員利用RT-qPCR方法在134例樣本(58例CC,76例NC)中驗證了sEVs來源的let-7b-3p、miR-150-3p、miR-145-3p和miR-139-3p的診斷性能(圖4)。研究數(shù)據(jù)顯示,四個miRNA的曲線下面積(the area under the ROC curve,AUC)分別為0.792、0.686、0.692和0.679。經(jīng)過進(jìn)一步邏輯回歸模型分析,let-7b-3p、miR-145-3p和miR-139-3p的組合AUC可高達(dá)0.927。
4. miRNA診斷性能比較
sEVs中的miRNA是血漿總miRNA的一部分,為研究sEVs來源miRNA作為生物標(biāo)志物的必要性,該研究對比分析了sEVs來源miRNA和血漿總miRNA中候選標(biāo)志物的診斷性能(圖5)。結(jié)果顯示,與血漿總miRNA相比,sEVs來源miRNA有著更高的AUC和診斷潛能。對比多個miRNA panels,分離后的sEVs miRNA在早期CC患者的識別、診斷中有著非常明顯的優(yōu)勢。 (生物谷Bioon.com)
小編推薦會議 2020(第五屆)外泌體與疾病研討會
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