在一項新的研究中,來自日本大阪市立大學(xué)、東京大學(xué)醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所和美國布萊根婦女醫(yī)院的研究人員報告了復(fù)發(fā)性艱難梭菌感染(recurrent Clostridioides difficile infection, rCDI)患者糞便樣本中的腸道細(xì)菌和病毒宏基因組信息。該綜合分析揭示了rCDI中參與發(fā)病的細(xì)菌和噬菌體,以及它們對腸道菌群功能恢復(fù)的重要途徑。相關(guān)研究結(jié)果于2021年2月9日在線發(fā)表在Gastroenterology期刊上,論文標(biāo)題為“Functional Restoration of Bacteriomes and Viromes by Fecal Microbiota Transplantation”。
圖片來自Gastroenterology, 2021, doi:10.1053/j.gastro.2021.02.013。
復(fù)發(fā)性艱難梭菌感染(rCDI)發(fā)生在腸道內(nèi),是由革蘭氏陽性、形成孢子的厭氧菌--艱難梭菌---引起的,它的孢子附著在糞便上并由人從手轉(zhuǎn)移到口腔中。正在接受抗生素治療的患者尤其容易感染,這是因為維持健康腸道的微生物會受到抗生素的極大破壞。
糞便微生物群移植(FMT)被認(rèn)為是一種有效治療rCDI的替代療法,這是因為它通過糞便移植用健康的微生物群替換受損的微生物群。然而,2019年報道了兩起接受FMT后因抗生素耐藥細(xì)菌感染而導(dǎo)致的死亡事件,這表明需要對FMT進(jìn)行改造或采用替代品來解決圍繞該療法的安全問題。
在這項新的研究中,這些研究人員正面解決了這一挑戰(zhàn)。利用他們在2020年報道的原始分析管線,他們從布萊根婦女醫(yī)院成功進(jìn)行FMT的9名rCDI患者的糞便樣本中獲得了腸道細(xì)菌和病毒宏基因組信息。他們揭示了參與rCDI發(fā)病的細(xì)菌和噬菌體,以及對腸道菌群功能恢復(fù)至關(guān)重要的途徑。
通過揭示腸道中的細(xì)菌組(bacteriome)和病毒組(virome)是如何作為一個器官一起發(fā)揮作用的,這些研究人員能夠展示FMT如何像用一個好的器官替換一個壞的器官一樣安全。
論文共同通訊作者、大阪市立大學(xué)的Satoshi Uematsu教授說,“腸道微生物群絕對應(yīng)該被當(dāng)作一個器官來對待!FMT極大地改變了腸道細(xì)菌組和病毒組,應(yīng)當(dāng)會恢復(fù)腸道細(xì)菌和病毒功能?!?/p>
在后COVID-19的世界里,rCDI將成為更緊迫的國際疾病之一。毫無疑問,F(xiàn)MT是針對rCDI的重要治療策略。Kosuke Fujimoto博士和Imoto Seiya教授說,“除了各種臨床調(diào)查外,全面的宏基因組分析對考慮FMT的安全性非常重要。”(世聯(lián)博研(Bioexcellence) 世聯(lián)博研Bioexcellence)
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