越來(lái)越多的證據(jù)表明，下呼吸道微生物群會(huì)影響肺部健康。然而，微生物群落組成與肺動(dòng)態(tài)平衡之間的聯(lián)系仍然難以捉摸。對(duì)此，在最近一項(xiàng)研究中，來(lái)自瑞士洛桑大學(xué)的Laurent P. Nicod團(tuán)隊(duì)結(jié)合了擴(kuò)增子測(cè)序和細(xì)菌培養(yǎng)技術(shù)，表征了來(lái)自64個(gè)肺移植受體的234個(gè)支氣管肺泡灌洗樣品中的活細(xì)菌群落縱向特征，并建立起與病毒載量，宿主基因表達(dá)，肺功能和移植健康的聯(lián)系。相關(guān)結(jié)果發(fā)表在最近的《Nature Communications》雜志上。

為了表征移植后肺微生物群的細(xì)菌群落組成，作者在49個(gè)月的時(shí)間內(nèi)對(duì)64個(gè)肺移植受者的234個(gè)縱向BALF樣品進(jìn)行了16S rRNA基因擴(kuò)增子測(cè)序，總共鑒定出7164個(gè)“操作分類單元（OTU）”。根據(jù)先前對(duì)健康非移植個(gè)體的BALF樣品的研究，作者發(fā)現(xiàn)，擬桿菌和硬毛菌是移植后受體肺臟中最豐富的細(xì)菌門類，其次是，其次是變形桿菌和放線菌。對(duì)所有BALF樣本的患病率分析表明，其菌落構(gòu)成差異很大，≥50％的樣本屬于22個(gè)OUT，表明它們是移植后肺微生物群的主要成員。它們屬于Prevotella，Streptococcus，Veillonella，Neisseria，Alloprevotella，Pseudomonas，Gemella，Granulicatella，Campylobacter，Porphyromonas 以及Rothia，其中大多數(shù)也是健康人肺中的主要成員，這表明在健康的肺和移植的肺之間，肺微生物群的整體組成有相當(dāng)大的重疊。

（圖片來(lái)源：www.nature.com）

為了證明肺部微生物的生存能力并建立人肺細(xì)菌分離株的參考目錄以進(jìn)行實(shí)驗(yàn)研究，作者通過(guò)細(xì)菌培養(yǎng)方法對(duì)擴(kuò)增子測(cè)序進(jìn)行了補(bǔ)充：他們從18個(gè)個(gè)體中提取了21個(gè)隨機(jī)BALF樣品，在15種不同的半固體培養(yǎng)基（常規(guī)培養(yǎng)基和選擇性培養(yǎng)基）的基礎(chǔ)上，結(jié)合3種氧氣濃度（有氧，5％CO2和厭氧）進(jìn)行差異化培養(yǎng)。最終獲得了300種細(xì)菌分離物，分別屬于5個(gè)門，7個(gè)綱，13個(gè)目和17個(gè)科，進(jìn)而建立了一個(gè)可開(kāi)放獲取的生物庫(kù)，稱為“肺微生物群培養(yǎng)物保藏中心”（LuMiCol）。之后，作者利用機(jī)器學(xué)習(xí)的手段將肺活檢樣品按其內(nèi)在微生物菌落組成不同分為四類，分別為“PAM1”，“PAM2”，“PAM3”以及“PAM4”。該分類標(biāo)準(zhǔn)也得到了培養(yǎng)物組學(xué)的進(jìn)一步驗(yàn)證。

（圖1，高通量測(cè)序結(jié)合培養(yǎng)組學(xué)揭示肺臟微生物組的多樣性特征）

綜上所述，作者通過(guò)結(jié)合微生物測(cè)序以及高通量培養(yǎng)組學(xué)的手段，發(fā)現(xiàn)移植后的肺微生物群可分為四個(gè)不同的組成狀態(tài)，即“肺型”。主要的“平衡”型肺臟的特征是具有中等載量的多樣化細(xì)菌群落，并且宿主基因表達(dá)譜表明具有免疫耐受性。其他三種的特征是微生物群落貧乏或被潛在病原體所支配，并伴隨著免疫活性增加，呼吸功能降低以及感染和排斥的風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān)?？偟膩?lái)說(shuō)，作者的發(fā)現(xiàn)將移植后的肺微生物生態(tài)系統(tǒng)，肺功能和臨床穩(wěn)定性之間建立了聯(lián)系。（生物谷Bioon.com）

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