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        2021-11-19至2021-11-20 上海
        導(dǎo)航

        癌癥免疫技術(shù)進(jìn)展:從免疫基因組學(xué)到單細(xì)胞分析和人工智能

        來源:生物谷

        免疫療法在癌癥治療中起著至關(guān)重要的作用。然而,由于只有少數(shù)患者對(duì)免疫檢查點(diǎn)阻斷和其他免疫治療策略有反應(yīng),需要更多的新技術(shù)來破譯腫瘤細(xì)胞與腫瘤免疫微環(huán)境(TIME)組分之間復(fù)雜的相互作用。腫瘤免疫組學(xué)是指TIME利用免疫基因組學(xué)、免疫蛋白質(zhì)組學(xué)、免疫生物信息學(xué)等反映腫瘤免疫狀態(tài)的多組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行的綜合研究,依賴于下一代測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展。高通量基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可用于計(jì)算免疫細(xì)胞豐度和預(yù)測(cè)腫瘤抗原,參考免疫基因組學(xué)。然而,由于批量測(cè)序代表了異質(zhì)細(xì)胞群體的平均特征,它不能區(qū)分不同的細(xì)胞亞型。然而,由于批量測(cè)序代表了異質(zhì)細(xì)胞群體的平均特征,它不能區(qū)分不同的細(xì)胞亞型。此外,放射組學(xué)和基于數(shù)字病理學(xué)的深度學(xué)習(xí)模型在很大程度上有助于癌癥免疫的研究。這些人工智能技術(shù)在預(yù)測(cè)免疫治療反應(yīng)方面表現(xiàn)良好,對(duì)癌癥治療具有重要意義。本文對(duì)免疫基因組學(xué)、單細(xì)胞和人工智能領(lǐng)域的傳統(tǒng)技術(shù)和最新技術(shù)進(jìn)行了簡(jiǎn)要的綜述,并對(duì)未來的研究進(jìn)行了展望。


        圖片來源:https://doi.org/10.1038/s41392-021-00729-7

        腫瘤細(xì)胞與鄰近的細(xì)胞共同存在于復(fù)雜的群落中,這強(qiáng)烈影響著腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)、行為以及與其他細(xì)胞的交流。在這些細(xì)胞中,免疫細(xì)胞是關(guān)鍵的參與者,許多研究已經(jīng)證明,腫瘤細(xì)胞和免疫細(xì)胞之間的串?dāng)_是雙向的。事實(shí)上,免疫細(xì)胞既能促進(jìn)癌癥的發(fā)生,又能抑制腫瘤的進(jìn)展、轉(zhuǎn)移和復(fù)發(fā)。因此,這里關(guān)注的是腫瘤免疫微環(huán)境(TIME)。因此,促進(jìn)從親腫瘤向抗腫瘤的轉(zhuǎn)變,最大限度地發(fā)揮抗腫瘤免疫作用是免疫治療的主要目標(biāo)。最近的腫瘤免疫治療策略,如免疫檢查點(diǎn)阻斷(ICBS)、腫瘤疫苗和過繼細(xì)胞轉(zhuǎn)移(ACT)治療,已顯示出前所未有的臨床療效。然而,在面臨治療耐藥性和不良反應(yīng)等問題時(shí),由于對(duì)腫瘤免疫的不完全了解,它們的應(yīng)用受到阻礙。

        盡管在探索腫瘤-免疫相互作用機(jī)制方面取得了很大的進(jìn)展,傳統(tǒng)的技術(shù),如western blotting (WB)、Co-IP (Co-IP)和實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)(RT-qPCR),不能提供一個(gè)完整的時(shí)間全景。迫切需要新的方法來詳細(xì)描述腫瘤免疫學(xué)特征。應(yīng)用基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、表觀基因組學(xué)、細(xì)胞學(xué)、信息學(xué)等高通量技術(shù)全面了解腫瘤免疫已成為一門嶄新的學(xué)科,即腫瘤免疫組學(xué),為研究者提供了新的視角。新一代測(cè)序技術(shù)極大地促進(jìn)了免疫基因組學(xué)的發(fā)展,免疫基因組學(xué)是免疫基因組學(xué)的一個(gè)重要分支。此外,近年來,單細(xì)胞測(cè)序和人工智能(AI)引領(lǐng)了腫瘤免疫的新時(shí)代。由于腫瘤免疫學(xué)生物信息學(xué)的巨大發(fā)展,越來越多的技術(shù)和潛在的臨床意義是一個(gè)非常值得關(guān)注的問題。


        腫瘤免疫微環(huán)境的組成和相互作用

        圖片來源:https://doi.org/10.1038/s41392-021-00729-7

        很明顯,隨著免疫組學(xué)領(lǐng)域新興技術(shù)的巨大飛躍,我們現(xiàn)在能夠以前所未有的深度剖析腫瘤免疫。在這篇綜述中,作者介紹了腫瘤免疫學(xué)的傳統(tǒng)技術(shù)和最新技術(shù),并展望了臨床應(yīng)用前景,以供研究人員參考。(生物谷 Bioon. com

        小編推薦會(huì)議 2021 (第四屆)單細(xì)胞多組學(xué)研究與臨床應(yīng)用峰會(huì)


        http://meeting.bioon.com/2021SC


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