北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)、生命科學(xué)學(xué)院,北京未來基因診斷高精尖創(chuàng)新中心(ICG)張澤民課題組聯(lián)合中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院劉芝華課題組、馬飛和徐兵河課題組,在國際期刊Cancer Cell上以Article形式在線發(fā)表了題為“Single-cell analyses reveal key immune cell subsets associated ...
哺乳動物腦細(xì)胞在基因表達(dá)、解剖和功能方面表現(xiàn)出顯著的多樣性,但這種廣泛異質(zhì)性背后的調(diào)控方式尚不清楚。近日,來自美國的科研團(tuán)隊在《Nature》雜志發(fā)表了題為“DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolution”的研究成果,通過單核DNA甲基化測序?qū)π∈蠖鄠€腦區(qū)的表觀遺傳學(xué)特征進(jìn)行了圖譜化分析。研究...
近日,中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院醫(yī)工所微納系統(tǒng)與仿生醫(yī)學(xué)研究中心研究員陳艷和南加州大學(xué)教授鐘江帆合作,在針對稀有細(xì)胞樣本的單細(xì)胞測序技術(shù)方面取得新進(jìn)展。相關(guān)研究成果以Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a microfluidic phase-switch device 為題在線發(fā)表于《分析學(xué)家》(Anal...
隨著單細(xì)胞測序技術(shù)的快速發(fā)展,多個全球性的、大規(guī)模的細(xì)胞圖譜項目相繼啟動,例如人類細(xì)胞圖譜計劃等。然而,把來自于不同組織、不同發(fā)育階段或者只有很少重疊細(xì)胞類型的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集進(jìn)行準(zhǔn)確有效的整合仍然具有非常大的挑戰(zhàn)性。因為當(dāng)前整合單細(xì)胞數(shù)據(jù)的方法需要校正批次效應(yīng)從而達(dá)到整合分析的目的,而上述所涉及的數(shù)據(jù)集的批次信息不清晰,利用這些方法常常會導(dǎo)致校正過度或者校正不足等問題,從而影響研究結(jié)論的準(zhǔn)確性...
近日,中國科學(xué)院北京基因組研究所(國家生物信息中心)研究員王前飛研究組,首次繪制了小鼠巨核細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜,揭示了體內(nèi)巨核細(xì)胞在分子、空間分布及功能上的異質(zhì)性,在此基礎(chǔ)上提出了一種新的巨核細(xì)胞分類系統(tǒng),而免疫巨核群體可能是一個新型造血分支。以往研究對巨核細(xì)胞功能的認(rèn)識局限于產(chǎn)生具有止血凝血功能的血小板,而近年來的研究發(fā)現(xiàn),巨核細(xì)胞具有微環(huán)境調(diào)控及免疫調(diào)節(jié)等多種功能,這些不同功能究竟由相同細(xì)胞...
近日,中國科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所單細(xì)胞分析研究組研究員陸瑤團(tuán)隊在高通量單細(xì)胞外囊泡分泌分析技術(shù)研究中取得新進(jìn)展,研究利用臺式掃描儀實(shí)現(xiàn)了高通量單細(xì)胞外囊泡分泌分析。近年來,單細(xì)胞分析技術(shù)迅速發(fā)展并推動了生物醫(yī)學(xué)的研究,然而目前大部分單細(xì)胞分析技術(shù)依賴體積龐大、價格昂貴的儀器進(jìn)行單細(xì)胞計數(shù)以及生物分子信號檢測,難以廣泛應(yīng)用。因此,亟需簡便、易于操作、低成本的分析平臺實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞外囊泡分泌...
全長的SMART-seq單細(xì)胞RNA測序能用于測定基因在同源異構(gòu)體分辨率下的表達(dá),從而就為識別出不同細(xì)胞類型的特定同位素標(biāo)記成為可能,與空間RNA捕獲和基因標(biāo)記方法結(jié)合使用就能使得對不同細(xì)胞類型的空間解析同源異構(gòu)體表達(dá)的推斷成為可能。構(gòu)建復(fù)雜的人類大腦以及大約1000億個單獨(dú)的神經(jīng)元圖譜并不是一件容易的事情;作為應(yīng)對這一巨大挑戰(zhàn)的“前奏”,研究人員已經(jīng)從對小鼠大腦的研究來理解大腦中不同的細(xì)胞類型以...
脊髓是外周系統(tǒng)與大腦間信號傳遞的橋梁。脊髓背角介導(dǎo)著外周感受信號,而腹側(cè)對于運(yùn)動功能的執(zhí)行至關(guān)重要,同時也是低級反射的中樞。作為一種高度有序的中樞組織,脊髓由多種不同的細(xì)胞類型有序發(fā)育形成。雖然脊髓的發(fā)育在嚙齒類動物中已進(jìn)行了一系列的研究,但對人類脊髓發(fā)育過程了解較少。中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所戴建武再生醫(yī)學(xué)團(tuán)隊長期從事脊髓損傷再生修復(fù)研究。戴建武研究組與南京鼓樓醫(yī)院教授胡婭莉團(tuán)隊近期首次通...
-許多疾病起源于人類早期發(fā)育。一項新的研究揭示了來自人類細(xì)胞圖譜(HCA)聯(lián)盟的研究人員如何推進(jìn)這方面的理解。HCA聯(lián)盟正在繪制人體的每一種細(xì)胞類型,以改變我們對生物學(xué)、感染和疾病的認(rèn)識。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2021年9月9日的兩篇Nature論文中,論文標(biāo)題為“Cells of the human intestinal tract mapped across space and time”和“A ...
近日,美國哈佛醫(yī)學(xué)院科研人員在Nature Communications上發(fā)表了題為“Bacterial variability in the mammalian gut captured by a single-cell synthetic oscillator”的文章,利用單細(xì)胞基因振蕩器檢測到哺乳動物腸道中的細(xì)菌變異性。基因振蕩器是基于一種人工合成的震蕩性基因回路而開...
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