生物體內(nèi),復(fù)雜的基因網(wǎng)絡(luò)是細(xì)胞發(fā)揮功能的基礎(chǔ)。特定環(huán)境下,不同基因間相互交流將決定細(xì)胞命運(yùn)。發(fā)展操控生物系統(tǒng)分子工具的一個(gè)重要目標(biāo)是能夠人為構(gòu)建基因回路以調(diào)控細(xì)胞功能或控制細(xì)胞表型。比如,細(xì)胞內(nèi)原本獨(dú)立表達(dá)的X與Y兩個(gè)基因,在引入人為構(gòu)建的合成回路后,RNA-X能發(fā)揮調(diào)控RNA-Y表達(dá)的作用(圖1)。試想,在癌細(xì)胞中,如果X為原癌基因, Y為抑癌基因,在兩者間建立基因回路,以原癌基因誘發(fā)抑癌基因表達(dá),將可能實(shí)現(xiàn)細(xì)胞癌變的源頭防治;而如果X為病毒基因,Y為免疫相關(guān)基因,入侵的病毒引起某些免疫相關(guān)基因的表達(dá),將可能實(shí)現(xiàn)劇烈地激活免疫反應(yīng)以清除病毒。因此,建立細(xì)胞內(nèi)源基因的關(guān)聯(lián)調(diào)控將可能為細(xì)胞引入主動(dòng)防御機(jī)制,以調(diào)節(jié)其在不同環(huán)境下的響應(yīng)行為,而這也是人工改造細(xì)胞的一個(gè)重要目的。
依據(jù)堿基互補(bǔ)配對原則的動(dòng)態(tài)RNA技術(shù)為構(gòu)建基因回路提供了一種通用方法。同時(shí),迅猛發(fā)展的CRISPR/Cas9技術(shù)為基因表達(dá)調(diào)控提供了有效工具。中山大學(xué)化學(xué)學(xué)院徐亮教授課題組前期的研究(圖2),通過引入雙發(fā)卡中間體調(diào)節(jié)CRISPR/Cas9功能,進(jìn)而調(diào)控目標(biāo)基因,在大腸桿菌和哺乳動(dòng)物細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)了獨(dú)立內(nèi)源基因間的聯(lián)系(Nucleic Acids Research, 2020, 48, 11773.)。然而,該策略涉及的組分較多,而且雙發(fā)卡的設(shè)計(jì)較為復(fù)雜,急需發(fā)展更加簡易高效的分子工具。
近日,在之前的研究基礎(chǔ)上,中山大學(xué)化學(xué)學(xué)院徐亮教授課題組報(bào)道了一種設(shè)計(jì)簡單且通用的自組裝策略(圖3),通過工具化的核酸自組裝體系并聯(lián)合可激活的CRISPR/Cas9功能實(shí)現(xiàn)了內(nèi)源RNA之間的關(guān)聯(lián)調(diào)控,在大腸桿菌中高效地建立起了完全獨(dú)立的內(nèi)源基因回路,成功地實(shí)現(xiàn)了對大腸桿菌的表型控制。此外,初步探索表明此自組裝策略也同樣能夠在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)。這種RNA自組裝策略為生物體內(nèi)相互獨(dú)立的內(nèi)源基因之間構(gòu)建基因回路提供了簡單、通用、高效的方案。該策略在理論上能夠在任意基因表達(dá)之間建立起關(guān)聯(lián)調(diào)控作用,從而在細(xì)胞內(nèi)引入新型調(diào)控途徑和信號通路。(世聯(lián)博研(Bioexcellence)世聯(lián)博研Bioexcellence)
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