在最近一項研究中，UT西南大學的科學家們已經(jīng)開發(fā)出一種新的方法來研究T細胞的分子特征。今天在《Nature Methods》雜志上描述的該方法使研究人員能夠更輕松地分析T細胞受體（TCR）的作用，即T細胞表面上負責識別病原體的分子。

研究組負責人，人口與數(shù)據(jù)科學助理教授Tao Wang博士說：“這可以使人們更好地了解T細胞的工作方式以及利用T細胞對抗疾病的新方法?！?/p>

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盡管某些免疫細胞可以同時攻擊不同的病原體，但T細胞具有更強的針對性-每個單獨的T細胞在其表面上都有一組獨特的T細胞受體（TCR）。每個受體通常僅識別一個特定分子或“抗原”。例如，一個TCR可能僅與肺癌中發(fā)現(xiàn)的一種蛋白質(zhì)結(jié)合，而另一個TCR可能僅與一種流感病毒結(jié)合。當T細胞遇到與其TCR之一結(jié)合的抗原時，它會被激活，從而引發(fā)免疫反應。為了抵御各種各樣的潛在入侵者，人類體內(nèi)存在數(shù)百萬種不同的T細胞。
 

科學家試圖研究是什么使不同的T細胞和TCR或多或少地有效，但到目前為止，由于缺乏有關(guān)各種TCR的功能的信息而受到阻礙。通常，他們認為外觀相似的TCR必須結(jié)合相似的抗原，并且所有TCR都以相似的方式激活T細胞。
 
對此，研究團隊開發(fā)了一種統(tǒng)計模型，該模型結(jié)合了兩種現(xiàn)有技術(shù)：TCR分析（用于測量人的TCR多樣性）和單細胞RNA測序（用于識別在T細胞中打開或關(guān)閉的特定基因）。結(jié)合這些技術(shù)一直是一個挑戰(zhàn)，因為它們每個實驗都會生成成千上萬的數(shù)據(jù)，并且數(shù)據(jù)以兩種不同的形式出現(xiàn)。這一名為Tessa的新模型使用了強大的統(tǒng)計方法來彌補這一差距。 Tessa揭示了單個T細胞的TCR識別抗原時會發(fā)生什么，以及TCR以何種方式影響T細胞的功能。 
 
研究人員使用Tessa研究了來自健康人和癌癥患者的100,288個T細胞。在癌癥患者中，他們發(fā)現(xiàn)T細胞中TCR的多樣性對T細胞功能狀態(tài)的影響比對健康患者的影響更弱。這可能是因為分泌到腫瘤微環(huán)境中的大量其他免疫分子以其他方式影響T細胞活性。這一發(fā)現(xiàn)以及其他可能是由于Tessa的更廣泛使用而引起的其他發(fā)現(xiàn)，可能對設(shè)計基于免疫的癌癥治療方法的科學家產(chǎn)生影響。
 

內(nèi)科醫(yī)學教授， UT西南大學Harold C. Simmons綜合癌癥中心的臨床研究副主任David Gerber博士認為，這項工作為使用單T細胞測序數(shù)據(jù)提供了一種全新的方法。

UTSW放射腫瘤學助理教授Todd Aguilera博士補充說：“先前的技術(shù)涉及T細胞的確切功能以及T細胞受體如何與功能相關(guān)的猜想。我相信這種方法可以幫助鑒定最有前途的TCR，用于基于TCR的個性化免疫治療，并更好地定義生產(chǎn)性免疫反應，以指導最佳免疫治療策略的鑒定?！保ㄉ锕菳ioon.com）

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